La idea de fundar una nueva universidad aparece a principios de 1998 por iniciativa de un grupo de hondureños que tenían como objetivo contribuir en la Educación Superior en Honduras.

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Bajo estas expectativas se realiza la primera reunión el día 21 de marzo de 1998, con la asistencia de diez miembros que integraron la primera junta directiva de la Fundación Universidad Metropolitana de Honduras.

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Durante 1998 se realizaron algunas actividades como:​

• Elaboración de los estatutos de la Fundación y elevar la solicitud de aprobación de la Personería Jurídica ante el Ministerio de Gobernación.

• Elaboración del perfil de la Universidad Metropolitana de Honduras.